生物分類法

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生物分類學(xué)
分類單元
域 | 界 | 門 | 綱 目 | 科 | 屬 | 種
二名法
三域系統(tǒng)
非細(xì)胞生物 病毒
細(xì)胞生物 古菌域 細(xì)菌域 真核域 真菌界 原生生物界 植物界 動(dòng)物界

生物分類法，又稱科學(xué)分類法，是生物學(xué)用來(lái)對(duì)生物的物種歸類的辦法?，F(xiàn)代生物分類法源于林奈的系統(tǒng)，他根據(jù)物種共有的生理特征分類。在林奈之后，根據(jù)達(dá)爾文關(guān)于共同祖先的原則，此系統(tǒng)被逐漸改進(jìn)。近年來(lái)，分子系統(tǒng)學(xué)應(yīng)用了生物信息學(xué)方法分析基因組DNA，正在大幅改動(dòng)很多原有的分類。生物分類法屬于分類學(xué)以及生物系統(tǒng)學(xué)。

目錄 1 現(xiàn)代發(fā)展 2 早期分類系統(tǒng) 2.1 林奈氏分類法 3 舉例 4 分類級(jí)別 4.1 動(dòng)物的分類級(jí)別 5 屬以上級(jí)別學(xué)名之后綴 6 參見(jiàn) 7 外部鏈接 8 參考來(lái)源

現(xiàn)代發(fā)展

盡管林奈當(dāng)時(shí)對(duì)生物分類只是為了方便鑒別，現(xiàn)在人們已經(jīng)廣泛贊同分類應(yīng)反映出達(dá)爾文關(guān)于共同祖先的原則。

隨著1960年代支序分類（cladistics）或稱分支學(xué)說(shuō)（cladism）的出現(xiàn)，一個(gè)分類單元被定位在演化樹的某個(gè)位置。如果一個(gè)分類單元包括且僅包括某一個(gè)共同祖先的所有后代，稱其為單系群（monophyly）；相對(duì)應(yīng)的，若該單元包括其共同祖先，但未包括其所有后代，則稱之為并系群（paraphyly）；若該分類不包括其最近共同祖先，則稱之為復(fù)系群（polyphyly）。根據(jù)分支學(xué)說(shuō)，一個(gè)自然分類應(yīng)該是單系群而非并系或復(fù)系。

目前正在計(jì)劃一種新的命名法，稱做PhyloCode，用來(lái)處理演化支（clade）而非分類單元（拉丁文taxon，復(fù)數(shù)taxa）?，F(xiàn)在仍不清楚，這種新的命名法能否和其它的命名法則并存。

比較新的分類法中，域或稱總界是最高的單元。三域系統(tǒng)最初被創(chuàng)立于1990年，此后逐漸被學(xué)界承認(rèn)。目前，大多數(shù)學(xué)者已經(jīng)接受了此系統(tǒng)，但仍有一些學(xué)者遵循五界系統(tǒng)。三域系統(tǒng)的基本特征是將原本在細(xì)菌界（或稱原核生物界(Monera)）中的古細(xì)菌和真細(xì)菌獨(dú)立成細(xì)菌域(Bacteria)和古菌域(Archaea)。還有一些學(xué)者將古細(xì)菌列為第六個(gè)界但不接受三域系統(tǒng)。

個(gè)別科學(xué)家以“王國(guó)(界)之上是帝國(guó)”，借用政治和歷史上的概念，創(chuàng)立“帝國(guó)”的最大分類單位，把所有生物細(xì)胞有無(wú)核，分為真核生物和原核生物兩帝國(guó)。

早期分類系統(tǒng)

最早已知的對(duì)生命形式的分類系統(tǒng)由希臘哲學(xué)家亞里士多德所建立。他將動(dòng)物根據(jù)運(yùn)動(dòng)方式（空中，陸上或水中）分類。1172年塞維利亞的法官伊本·路世德（ibn Rushd，即阿維羅伊Averroes）將亞里士多德的《論靈魂》（拉丁文de Anima）翻譯成阿拉伯文并刪節(jié)。其原始注解已佚，但由斯考特（Michael Scot）翻譯的拉丁文版本仍流傳。

在中國(guó)，明代李時(shí)珍（約1518–1593）在藥典《本草綱目》中，將生物藥材分為草部、谷部、菜部、果部、木部、蟲部、鱗部、介部、禽部、獸部和人部。瑞士教授康拉德·馮·蓋斯納（Conrad von Gesner, 1516–1565）將當(dāng)時(shí)已知的生物進(jìn)行了分析性的歸納。

新大陸的發(fā)現(xiàn)為歐洲帶來(lái)了很多新奇的動(dòng)物種類的描述和標(biāo)本。在16世紀(jì)晚期和17世紀(jì)早期，人們開始對(duì)動(dòng)物進(jìn)行了詳細(xì)描述，先是人們熟悉的種類，隨后逐漸擴(kuò)展，直到形成了基于解剖學(xué)基礎(chǔ)的足夠大的知識(shí)體系。這些解剖學(xué)知識(shí)主要來(lái)源于醫(yī)學(xué)解剖學(xué)家，隨后昆蟲學(xué)家和最初的顯微鏡學(xué)者將分類的范圍進(jìn)一步擴(kuò)大。

林奈氏分類法

卡爾·林奈（Carolus Linnaeus, 1707–1778）的巨著《自然系統(tǒng)》（拉丁文Systema Naturae）在其一生中被改編過(guò)12次（1735年第一版）。在此書中，自然界被劃分為三個(gè)界：礦物、植物和動(dòng)物。林奈用了四個(gè)分類等級(jí)：綱、目、屬和種。

林奈所建立了用于命名所有物種的學(xué)名的方法，并沿用至今。在林奈之前，命名一個(gè)物種需要很長(zhǎng)的包括許多單詞的名稱，其中包括了對(duì)物種的描述，并且這些名稱不固定。林奈將物種名稱統(tǒng)一成兩個(gè)單詞的拉丁文名稱，即學(xué)名，由此分開了命名法和分類法。這種生物命名的方法稱作雙名法，具體命名辦法和書寫規(guī)則參見(jiàn)雙名法條目。

目前，命名法由命名法規(guī)（Nomenclature Codes）所管理。命名包括了不同等級(jí)的分類單元的名稱。

盡管在漢語(yǔ)中，各物種及分類單元有對(duì)應(yīng)的漢語(yǔ)名稱，但在學(xué)術(shù)上為了方便交流和避免一物多名或一名多物的問(wèn)題發(fā)生，所有國(guó)家仍通用拉丁語(yǔ)的命名法，物種的學(xué)名也專指雙名法的名稱。拉丁語(yǔ)的好處在于，它基本已經(jīng)是一種“死”的語(yǔ)言，不再用作口語(yǔ)，因此相對(duì)穩(wěn)定。

舉例

常見(jiàn)的五種細(xì)胞生物（果蠅、人、豌豆、釀酒酵母和大腸桿菌）的名稱和分類如下：

菌綠素種類	光合細(xì)菌	最大吸收峰(nm)	乙醇中最大吸收峰(nm)	作用
菌綠素a (BChl a)	紫細(xì)菌、綠硫細(xì)菌和綠非硫細(xì)菌	800-810, 850-890	364, 770	反應(yīng)中心或天線
菌綠素b (BChl b)	紫細(xì)菌	1015-1035	373, 795	反應(yīng)中心或天線
菌綠素c (BChl c)	綠硫細(xì)菌和綠非硫細(xì)菌	745-760	434, 666	天線
菌綠素d (BChl d)	綠硫細(xì)菌	725-745	427, 655	天線
菌綠素e (BChl e)	綠硫細(xì)菌	715-725	469, 654	天線
菌綠素g (BChl g)	太陽(yáng)桿菌	770-790		反應(yīng)中心

注：

• 表中很多分類尚有分歧，除細(xì)菌參照伯杰氏手冊(cè)^{[-{zh:失效連結(jié);zh-tw:失效連結(jié);zh-cn:失效鏈接}-]}的分類大綱外，其余按照傳統(tǒng)分類，未有統(tǒng)一標(biāo)準(zhǔn)，謹(jǐn)作參考。
• 植物學(xué)和微生物學(xué)家用系統(tǒng)方法對(duì)較高級(jí)的分類單元命名，即用拉丁文中模式屬（type genus）屬名的詞干加上標(biāo)準(zhǔn)的詞尾來(lái)命名這個(gè)單元（見(jiàn)下表）。例如，薔薇科的“科長(zhǎng)”（即模式屬）是薔薇屬(Rosa)，其詞干為“Ros-”，則薔薇科的拉丁名即為“Ros-”加上植物的科的后綴“-aceae”成為“Rosaceae”。中文的大多數(shù)分類單元也是類似用法，但：
  1. 中文所用為高級(jí)單元的取名的屬可能和拉丁文不同，如牻牛兒苗科(Geraniaceae)的中文名來(lái)源于牻牛兒苗屬(Erodium)，但其拉丁名來(lái)源于老鸛草屬(Geranium)。
  2. 拉丁名變更后中文名不一定變更。如唇形科拉丁名原根據(jù)形態(tài)命名為L(zhǎng)abiatae，現(xiàn)根據(jù)標(biāo)準(zhǔn)改為L(zhǎng)amiaceae，取名源自野芝麻屬(Lamium)，中文也不必將唇形科改譯作“野芝麻科”。
• 動(dòng)物學(xué)家通常只將類似命名法命名至科（包括總科）這一級(jí)，以上則多用描述法。

分類級(jí)別

• 為了更細(xì)致的分類，學(xué)者們?cè)陂T、綱、目、科、屬、種之外加了很多附屬級(jí)別。最常用的是“亞-”(sub-)，在正常級(jí)別之下，如“亞綱”、“亞科”等等。在正常級(jí)別之上則為“總-”(super-)，如“總目”。比“亞”更小的還有“下-”，或譯作“次-”(infra-)。但下目仍然要比總科大。此外，對(duì)于植物，在科和屬之間還有“族”(拉tribus, tribi，英tribe)，屬之下還有“-{zh-cn:組; zh-tw:節(jié);}-”(拉sectio, sectiones，英section)，再往下還能有“系”(拉、英series, series)。比較完整的種之上的分類單元的次序?yàn)椋ūM管目前大概沒(méi)有能把這些等級(jí)都用全的分類系統(tǒng)）：

域(總界) - 界 - 門 - 亞門 - 總綱 - 綱 - 亞綱 - 下綱 - 總目 - 目 - 亞目 - 下目 - 總科 - 科 - 亞科 - 族 - 亞族 - 屬 - 亞屬 - -{zh-cn:組; zh-tw:節(jié);}- - 亞-{zh-cn:組; zh-tw:節(jié);}- - 系 - 亞系 - 種

• 在種之下，動(dòng)植物還能分成“亞種”(subspecies，簡(jiǎn)寫subsp.)和“變種”(拉varietas, varietates，英variety，簡(jiǎn)寫var.)，植物還能加上栽培種名。比如現(xiàn)代智人的學(xué)名為Homo sapiens subsp. sapiens，或者也可以直接省掉亞種簡(jiǎn)寫直接寫成Homo sapiens sapiens。一種豌豆的變種的栽培種可寫成Pisum sativum var. macrocarpon 'Snowbird'。對(duì)于細(xì)菌和古菌，在種之下則用“株”(英strain)，如一株可以引起食物中毒的大腸桿菌菌株Escherichia coli O157:H7。注意只有屬之下的單位（包括亞種、變種）名用斜體，而屬級(jí)之上的單位、級(jí)別縮寫、栽培種名和菌株名用正體。
• 病毒與朊毒體(Prion)尚未有明確的分類。
• 注意：中文中任何分類單元均不使用斜體。

動(dòng)物的分類級(jí)別

• 界 Kingdom Animalia
  • 亞界 Subkingdom
    • 支 Branch
      • 下界 Infrakingdom
• 總門 Superphylum
  • 門 Phylum
    • 亞門 Subphylum
      • 下門 Infraphylum
        • 小門 Microphylum
• 總綱 Superclass
  • 綱 Class
    • 亞綱 Subclass
      • 下綱 Infraclass
        • 小綱 Parvclass
• 總部 Superlegion
  • 部 Legion
    • 亞部 Sublegion
      • 下部 Infralegion
• 總?cè)?Supercohort
  • 群 Cohor
    • 亞群 Subcohort
      • 下群 Infracohort
• 宏目 Gigaorder
  • 高目 Magnorder or Megaorder
    • 大目 Grandorder or Capaxorder
      • 上目 Mirorder or Hyperorder
        • 總目 Superorder
          • 系 Series (for fishes)
            • 目 Order
              • 從目 Nanorder
                • 次目 Hypoorder
                  • 若目 Minorder
                    • 亞目 Suborder
                      • 下目 Infraorder
                        • 小目 Parvorder or Microorder
• 宏科 Gigafamily
  • 高科 Megafamily
    • 大科 Grandfamily
      • 上科 Hyperfamily
        • 總科 Superfamily
          • 領(lǐng)科 Epifamily
            • 系 Series (for Lepidoptera)
              • 組 Group (for Lepidoptera)
                • 科 Family
                  • 亞科 Subfamily
                    • 下科 Infrafamily
• 總族 Supertribe
  • 族 Tribe
    • 亞族 Subtribe
      • 下族 Infratribe
• 屬 Genus
  • 亞屬 Subgenus
    • 下屬 Infraspecific
• 節(jié) Section
  • 亞節(jié) Subsection
• 種團(tuán) Superspecies or Species-group
  • 種 Species
    • 亞種 Subspecies
      • 型 Form/Morph

以下的分類級(jí)別可用于綱之下、目之下、或科之下。常見(jiàn)于恐龍的分類。

• Superdivision
  • Division
    • Subdivision
      • Infradivision

屬以上級(jí)別學(xué)名之后綴

在屬以上級(jí)別的分類單元的學(xué)名通常由模式屬的詞干加上一個(gè)標(biāo)準(zhǔn)的后綴所構(gòu)成。后綴的選擇取決于分類單元傳統(tǒng)上所在的大類別，如下表所示：

分類單元	植物	藻類	真菌	原核生物	動(dòng)物
門	-phyta	-phyta	-mycota
亞門	-phytina	-phytina	-mycotina
綱	-opsida	-phyceae	-mycetes
亞綱	-idae	-phycidae	-mycetidae
總目	-anae
目	-ales
亞目	-ineae
下目	-aria
總科	-acea				-oidea
科	-aceae				-idae
亞科	-oideae				-inae
族	-eae				-ini
亞族	-inae				-ina

注意：

• 拉丁文的詞干可能并不能從主格的詞直接推斷出來(lái)，比如Homo（人屬）的詞根為homin-，而非hom-，因此人科不是Homidae而是Hominidae。
• 對(duì)于動(dòng)物，標(biāo)準(zhǔn)的詞尾只上推到總目（《國(guó)際動(dòng)物命名法規(guī)》(ICZN)中的27.2）。
• 對(duì)于原核生物，標(biāo)準(zhǔn)詞尾上推到目（目前總目等級(jí)沒(méi)有應(yīng)用），詞尾同植物、藻類、真菌。

參見(jiàn)

• 生物分類學(xué)
• 雙名法
• 三名法
• 林奈氏分類系統(tǒng)
• 國(guó)際植物命名法規(guī)（自2012年已更名作：《國(guó)際藻類、真菌、植物命名法規(guī)》）
• 國(guó)際動(dòng)物命名法規(guī)
• 國(guó)際細(xì)菌命名法規(guī)
• 國(guó)際病毒命名和分類法規(guī)
• 生物分類總表
• 系統(tǒng)發(fā)生樹
• 種系發(fā)生

外部鏈接

• PhyloCode（英文）
• NCBI分類（英文）
• 國(guó)際動(dòng)物命名法規(guī)（英文）
• 國(guó)際植物命名法規(guī)，2000年圣路易斯（英文）
• 《細(xì)菌名稱》

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參考來(lái)源

• 維基百科-生物分類法

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